扁桃体是人体头颈部的重要免疫器官，位于咽喉腔内。扁桃体摘除术后患者通常不会有特别严重的后遗症，主要可能有以下两方面症状。
一、咽喉不适
1.主要出现在扁桃体切除后不久。因为扁桃体是咽喉腔内的器官，切除后会导致咽喉黏膜及血管出现不同程度受损，从而可能引发咽喉疼痛、喉咙少量出血等情况。
2.手术刺激还会使咽部黏膜充血肿胀，影响唾液及食物下咽，进而出现咽部异物感。
3.扁桃体切除后喉腔容积会增大，患者说话时会因喉腔容积增大产生明显共鸣现象，导致说话声音改变。
二、机体免疫力下降
1.由于扁桃体属于机体免疫器官，切除后患者头颈部及胸部的免疫力会有所下降。
2.机体免疫力下降时，细菌、病毒等病原体容易突破人体防御屏障，侵入人体引发炎症性疾病，甚至会增加感冒、鼻炎、咽炎、气管炎、肺炎等呼吸系统感染性疾病的发病概率。
总之，扁桃体摘除术后可能出现咽喉不适和机体免疫力下降等情况，但一般不会有极为严重的后果。