男性尿道结石常见的症状有排尿困难，表现为尿线变细、射程变短，还可能出现点滴状排尿，严重时甚至完全不能排尿。据临床统计，约有半数以上的男性尿道结石患者会出现排尿困难的情况。
疼痛表现
排尿痛： 结石在尿道内移动时，会引起尿道的疼痛，疼痛可放射至阴茎头部。尤其是在排尿时，疼痛会明显加剧，有的患者疼痛较为剧烈，难以忍受。下腹部疼痛： 部分患者还可能出现下腹部的牵涉性疼痛，疼痛程度因人而异，有的表现为隐痛，有的则较为剧烈。
其他伴随症状
血尿： 尿道结石摩擦尿道黏膜，可导致黏膜出血，从而出现血尿。多数为镜下血尿，少数患者可出现肉眼血尿。一般来说，血尿的程度与结石对尿道黏膜的损伤程度有关。尿道分泌物： 结石刺激尿道黏膜，可引起尿道腺体分泌增加，出现尿道分泌物。分泌物可为黏液性或脓性，量多少不一。如果合并感染，分泌物的量会增多，且可能伴有异味。排尿中断： 当结石在尿道内突然嵌顿，可导致排尿中断，患者需要改变体位或用力才能继续排尿。这种情况在结石较小且活动度较大时较为常见。