怀孕45天看不到孕囊的原因主要有两个：一是胚胎着床时间晚，比如受精卵不是在子宫腔内着床，而是在输卵管等其他地方着床，由于输卵管营养条件不佳，导致受精卵在输卵管着床且生长发育不良，从而使其出现较晚；二是异位妊娠，即受精卵在子宫腔外着床，以前称为宫外孕。如果是异位妊娠却找不到孕囊，可能是因为血液中人绒毛膜促性腺激素（HCG）相对较低，所以孕囊尚未发育，也可能是由于妊娠处于特殊部位，如腹部妊娠，进而未发现孕囊。
怀孕45天看不到孕囊的注意事项如下：
一、营养方面：
1.要注意摄入充分的营养成分，做到荤素搭配合理。
二、睡眠方面：
1.在孕期要保证充足的睡眠，避免熬夜。
三、饮食方面：
1.要注意清淡饮食，避免食用辛辣刺激的食物。
四、运动方面：
1.可以适当进行运动，以增强身体的抵抗力。
总之，怀孕45天看不到孕囊可能存在多种情况，需要密切关注并做好相应的注意事项。