扁桃体发炎时常用的药物有抗生素类和对症治疗药物等。一般细菌感染引起的扁桃体发炎，可选用青霉素类抗生素，如阿莫西林等，通常用药后数天内症状会有所缓解。
抗生素类药物选择
青霉素类： 如果是细菌感染导致的扁桃体发炎，青霉素类药物是常用选择，像阿莫西林，它对多种细菌有抑制作用，能有效对抗引起扁桃体发炎的常见病菌。头孢类： 头孢菌素类药物也可用于扁桃体发炎，例如头孢拉定，对革兰阳性菌和部分革兰阴性菌有抗菌活性，能针对引发扁桃体炎症的病菌发挥作用。
对症治疗药物
解热镇痛药： 当扁桃体发炎伴有发热、咽痛等症状时，可使用对乙酰氨基酚来缓解发热和疼痛，一般服用后0.5 - 1小时左右能起到一定的退热止痛效果。糖皮质激素： 对于病情较重、有高热等情况的患者，有时会短期使用糖皮质激素，如地塞米松等，能快速减轻炎症反应，但需在医生严格评估下使用。
特殊人群用药注意
儿童： 儿童扁桃体发炎用药需谨慎，比如阿莫西林，儿童使用时要根据体重等情况调整剂量，且要注意观察是否有过敏等不良反应。2岁以下儿童使用解热镇痛药需遵医嘱，避免自行用药。孕妇： 孕妇扁桃体发炎用药更要慎重，抗生素的选择需考虑对胎儿的影响，一般会优先选择相对安全的药物，如经过严格评估后的青霉素类药物，而解热镇痛药的使用也需在医生指导下进行，避免使用可能对胎儿有不良影响的药物。
非药物辅助注意
饮食方面： 扁桃体发炎时要多喝水，每天至少保证1500 - 2000毫升的饮水量，有助于湿润咽喉，促进新陈代谢，缓解不适。同时要避免吃辛辣、油腻、刺激性食物，如辣椒、油炸食品等，这些食物可能会加重扁桃体的炎症反应。休息方面： 患者要保证充足的休息，让身体有足够的能量来对抗炎症，一般建议每天保证7 - 8小时的睡眠时间，有利于身体恢复。