牙根尖脓肿的治疗主要包括应急处理、根管治疗以及全身药物辅助治疗等方面。一般来说，牙根尖脓肿需要及时采取措施，否则可能会导致炎症扩散等问题。
应急处理方法
开髓引流： 首先要打开髓腔，建立引流通道，缓解根尖部的压力，通常在局部麻醉下进行，这能快速减轻患者的疼痛症状，一般操作后1 - 2天疼痛会明显缓解。切开排脓： 如果脓肿已经形成，且位置较表浅，需要在局麻下切开脓肿部位进行排脓，切开后要放置引流条，每天更换，促进脓液排出。
根管治疗步骤
根管预备： 要清理根管内的感染物质，通过使用根管器械去除根管内的坏死牙髓、细菌及其代谢产物等。一般需要分步骤进行，先初步清理，再逐步扩大根管，为后续填充做准备。根管消毒： 在根管内放置消毒药物，如氢氧化钙制剂等，杀灭残留的细菌，一般需要放置1 - 2周，让药物充分发挥杀菌作用。根管填充： 最后用根管填充材料严密填充根管，封闭根管系统，防止细菌再次侵入，填充后还可能需要做牙冠修复来保护患牙。
全身药物辅助治疗
抗生素使用： 可以根据病情口服抗生素，如头孢类抗生素联合甲硝唑等。头孢类抗生素能抑制细菌细胞壁的合成，起到杀菌作用；甲硝唑主要针对厌氧菌有较好的抗菌效果。一般口服3 - 5天，但具体用药需要根据患者的感染情况和身体状况由医生决定。抗炎药物： 对于疼痛较为明显的患者，可以口服非甾体类抗炎药，如布洛芬等，起到抗炎、镇痛的作用，能缓解患者的疼痛症状，但要注意按照说明书或医嘱服用，避免过量。