儿童扁桃体发炎时，常用的药物有抗生素类和清热解毒类等。一般细菌感染引起的扁桃体发炎，可选用抗生素，如青霉素类或头孢类抗生素，但具体用药需遵医嘱。
抗生素类药物
青霉素类： 如果儿童对青霉素不过敏，可选用青霉素类抗生素，它对多种细菌有抑制作用，能有效对抗引发扁桃体发炎的常见细菌。不过使用前需做青霉素皮试，确保无过敏反应。头孢类： 头孢类抗生素也是常用的，比如头孢克洛等，抗菌谱较广，对多种导致扁桃体发炎的病菌有作用。但要注意，使用头孢类药物期间不能饮酒。
清热解毒类药物
中成药： 有不少清热解毒的中成药可用于儿童扁桃体发炎，像小儿咽扁颗粒，它具有清热利咽、解毒止痛的功效，能缓解扁桃体发炎引起的咽喉肿痛等症状。还有蓝芩口服液，也有清热解毒、利咽消肿的作用，可辅助治疗扁桃体发炎。不过这类药物使用时要按照儿童的年龄和体重等合理服用。
对症治疗药物
退烧药： 如果儿童扁桃体发炎伴有发热，体温超过38.5℃时，可使用退烧药，如对乙酰氨基酚混悬滴剂，它能起到降温的作用，一般间隔4 - 6小时可以重复使用，24小时内不超过4次。但要注意按照儿童的体重准确用药。含片： 局部使用的含片也可缓解症状，比如西瓜霜含片，能起到消肿止痛、清咽利喉的作用，不过儿童使用时要避免误吞，需在成人监护下使用。儿童扁桃体发炎用药时一定要谨慎，严格遵循医生的指导，根据儿童的具体病情来选择合适的药物，同时要注意观察用药后的反应，如有不适及时就医。并且在用药期间要让儿童多休息，多喝水，保持清淡饮食，这样更有利于病情的恢复。