宝宝睡醒后咳嗽常见原因包括：一、睡眠时以迷走神经支配为主，对刺激不敏感，气道易堆积分泌物，觉醒后交感神经兴奋，会因感受到分泌物而咳嗽；二、部分宝宝存在呼吸道感染，鼻涕多，睡眠时倒流至咽部，醒后刺激咽部导致明显咳嗽；三、有些宝宝有过敏性咳嗽问题，常在晨起或夜间出现明显刺激性干咳；四、气道高反应，宝宝醒来后呼吸相对加快，吸入空气流量增多，刺激气管出现高反应状态而咳嗽。
一、关于睡眠时迷走神经支配导致气道分泌物堆积而咳嗽。在睡眠状态下，人体主要受迷走神经支配，此时身体对很多刺激的反应较为迟钝，所以气道内就容易积聚一些分泌物。而当宝宝睡醒后，交感神经开始兴奋，这时就会察觉到这些分泌物的存在，进而引发咳嗽症状。
二、针对呼吸道感染引发较多鼻涕倒流导致咳嗽。一些宝宝可能患上了呼吸道感染，这会使得他们有比较多的鼻涕产生。在睡眠过程中，这些鼻涕就会向后倒流进入咽部。当宝宝睡醒之后，咽部受到刺激，就会出现较为明显的咳嗽情况。
三、对于宝宝可能存在的过敏性咳嗽问题。有的宝宝可能会有过敏性咳嗽的状况，通常这种咳嗽会在晨起或者夜间表现出比较显著的刺激性干咳现象。
四、有关气道高反应引起咳嗽的情况。当宝宝醒来后，其呼吸会相对增快，吸入空气的流量比起睡觉时会有所增加，这样就会刺激气管产生高反应状态，从而导致咳嗽的发生。
如果宝宝长期在睡醒后咳嗽，那么需要警惕是否发生了下呼吸道感染或者处于过敏状态，此时建议及时带宝宝就医，以便明确病因并进行进一步的治疗。