跑步时脚背疼痛，可能的原因主要有以下几种：一是鞋子不合适导致脚背与鞋面摩擦、挤压；二是过度运动引起足背肌肉拉伤、足背筋膜炎、跗跖关节骨关节炎等。
一、足背肌肉拉伤：
1.跑步时脚部不慎扭伤或运动前未充分热身而产生运动损伤，就可能出现脚背疼痛，还可能伴有局部淤青。
2.处理方法为运动拉伤24小时内可局部冰敷来减轻疼痛，24小时后可热敷以促进血液循环和消肿。恢复期间应避免体育运动，可用弹力绷带或护踝进行局部包扎，防止活动加重损伤以促进恢复。
二、足背筋膜炎：
1.因跑步运动强度大或负重等致使足背筋膜负荷与牵拉较多，引发足背筋膜损伤和无菌性炎症，从而导致跑步脚背疼痛。
2.需停止运动并进行局部热敷，这样有利于扩张血管、改善血液循环。疼痛严重者可遵医嘱使用洛索洛芬钠凝胶贴膏局部贴敷，或使用双氯芬酸二乙胺乳胶剂局部涂抹并配合按摩来缓解症状。
三、跗跖关节骨关节炎：
1.长期运动劳损可能造成关节软骨磨损、退变，软骨磨损时关节内负荷增加，骨组织间相互摩擦引起关节疼痛，甚至能听到骨擦音。跑步时这种异常摩擦加重，骨擦音更明显，进而引起明显的脚背疼痛。
2.要及时制动，可遵医嘱使用塞来昔布、氨基葡萄糖等药物消炎镇痛。日常应避免经常负重、行走，也可局部注射玻璃酸钠润滑关节以减少摩擦。
总之，当跑步出现脚背疼痛时，要根据具体情况判断原因并采取相应的处理措施，若疼痛持续或加重应及时就医诊治。