支原体感染可以通过多种检查方法来确诊，常见的有病原学检查和血清学检查等。比如血清学检查中，肺炎支原体抗体检测是常用的方法之一，一般在感染后2-3周可检测到特异性抗体。
病原学检查
咽拭子培养： 医生会用棉签擦拭患者咽部取得样本，然后进行支原体培养。这种方法可以直接检测出是否有支原体存在，但培养过程相对耗时，通常需要2-3天才能出结果。支气管肺泡灌洗： 对于一些重症支原体感染的患者，可能会采用支气管肺泡灌洗的方法获取标本进行检查，能更准确地检测出支原体，但这是一种有创检查，一般在其他检查难以明确诊断时才会使用。
血清学检查
肺炎支原体抗体IgM检测： 一般感染肺炎支原体后，IgM抗体在1周左右开始出现，3-4周达到高峰，所以如果检测到IgM抗体阳性，提示近期有支原体感染。多数情况下，通过血液检测就可以进行该项检查，操作相对简便。肺炎支原体抗体IgG检测： IgG抗体出现较晚，但持续时间较长，单次IgG阳性不能区分是既往感染还是现症感染，如果恢复期抗体滴度较急性期有4倍及以上升高，也有助于诊断现症感染。
核酸检测
实时荧光定量PCR检测： 通过检测呼吸道标本中的支原体核酸来判断是否感染，这种方法灵敏度和特异性较高，而且相对快速，一般2-4小时左右就能出结果，可以早期诊断支原体感染。比如检测痰液、鼻咽拭子等标本中的支原体核酸，能精准地确定是否存在支原体的核酸，从而明确感染情况。