扁平疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的皮肤良性赘生物，目前治疗方法有多种。一般来说，治疗扁平疣可以采用药物治疗、物理治疗等方式。比如外用药物中，维A酸类药物是常用的，还有一些具有抗病毒作用的药物也可使用。
外用药物治疗
维A酸类药物：像维A酸乳膏就可以使用，它能调节细胞分化，起到一定的治疗扁平疣作用，但使用时要注意避免接触正常皮肤，而且部分人使用后可能会有轻度刺激症状，如局部发红、脱屑等。抗病毒药物：有5%咪喹莫特乳膏，它可以调节局部免疫，刺激机体产生抗病毒物质来发挥作用，但使用后可能会出现局部红斑、糜烂等不良反应。
物理治疗方法
冷冻治疗：利用低温使疣体坏死脱落。一般冷冻后局部会出现水疱，然后逐渐结痂脱落，通常需要多次治疗才能完全去除疣体，治疗后要注意保持局部清洁，避免感染。激光治疗：通过激光的热能破坏疣体组织。激光治疗相对较快，但术后要注意创面护理，防止感染，可能会有短暂的红肿、疼痛等情况，需要一定时间恢复。
免疫调节治疗
卡介菌多糖核酸：它可以调节机体免疫功能，辅助治疗扁平疣。通常需要多次注射，一般每周注射2 - 3次，通过调节免疫来帮助机体清除HPV病毒，但使用时要注意观察是否有过敏等不良反应。转移因子：能将致敏淋巴细胞的免疫信息传递给未致敏的淋巴细胞，增强细胞免疫功能，对扁平疣有一定的辅助治疗作用，不过具体使用要在医生指导下进行，并且要注意其可能存在的个体差异导致的效果不同。
日常注意事项
避免搔抓：扁平疣具有传染性，搔抓可能会导致疣体自身接种，使皮疹增多。所以要尽量避免用手搔抓患处，防止病情扩散。注意个人卫生：要保持皮肤清洁，不与他人共用毛巾、脸盆等个人物品，防止交叉感染。同时，要注意规律生活，增强自身免疫力，因为免疫力低下时更容易感染HPV引发扁平疣。