毛囊炎主要是由细菌等病原体感染毛囊引起的。比如金黄色葡萄球菌就很容易引发毛囊炎，大约有90%的毛囊炎是由金黄色葡萄球菌感染导致的。
细菌感染引发
金黄色葡萄球菌感染： 金黄色葡萄球菌是常见的引发毛囊炎的细菌。它容易定植在人的皮肤表面，当皮肤有微小破损时，就会趁机侵入毛囊，引起毛囊的炎症反应。比如长时间出汗、皮肤摩擦等导致皮肤轻微破损，就为金黄色葡萄球菌感染毛囊创造了条件。表皮葡萄球菌感染： 表皮葡萄球菌也会引起毛囊炎。它在正常皮肤表面也有存在，但当皮肤的防御功能下降时，就可能大量繁殖，引发毛囊发炎。像皮肤清洁不到位，油脂、污垢堆积，就可能影响皮肤的防御，让表皮葡萄球菌有可乘之机。
真菌感染导致
马拉色菌感染： 马拉色菌是一种嗜脂性真菌，在油性皮肤的人群中更容易繁殖。比如油性皮肤的人，如果不注意皮肤清洁，皮脂腺分泌的油脂为马拉色菌提供了丰富的营养，马拉色菌就会感染毛囊，引发毛囊炎。一般来说，油性皮肤的人患马拉色菌性毛囊炎的概率比干性皮肤的人要高一些。其他真菌： 除了马拉色菌，还有一些其他真菌也可能引起毛囊炎，但相对少见。比如皮肤癣菌中的某些类型，也可能侵犯毛囊，导致毛囊发炎，但这类情况在毛囊炎中所占比例较小。
机体自身因素影响
免疫力低下： 当人体的免疫力下降时，比如患有糖尿病、艾滋病等疾病，或者长期使用免疫抑制剂等药物，身体抵抗病原体的能力减弱，就更容易患上毛囊炎。例如，糖尿病患者由于血糖控制不佳，身体的免疫功能受到影响，皮肤容易受到细菌、真菌等病原体的侵袭，从而引发毛囊炎的概率会增加。毛发牵拉： 一些需要频繁牵拉毛发的情况也容易引发毛囊炎。比如长时间扎紧头发的人，头发过度牵拉毛囊，导致毛囊受损，容易引发毛囊炎。像一些运动员长时间扎着头发进行训练，就可能出现这种情况。另外，刮胡子等导致毛囊受损，也可能引发毛囊炎。