念珠菌感染常用抗真菌药物治疗，其中氟康唑较为常用，一般规范用药下能取得较好效果。
局部用药情况
阴道局部用药：对于外阴阴道假丝酵母菌病（念珠菌性阴道炎）的局部治疗，可选用克霉唑制剂，如克霉唑栓，常用的有0.15g或0.5g规格的，一般单次用药即可，但严重的可能需要适当增加用药次数。还有咪康唑制剂，像2%的咪康唑栓，每晚1粒，连用7日；或400mg的咪康唑栓，每晚1粒，连用3日。另外，制霉菌素制剂也可用于局部，如制霉菌素栓，10万单位，每晚1次，连用14日。皮肤黏膜局部念珠菌感染：比如口腔念珠菌感染的局部含漱，可使用2% - 4%的碳酸氢钠溶液漱口，能改变口腔酸碱度，抑制念珠菌生长。对于皮肤念珠菌感染，可外用克霉唑乳膏、咪康唑乳膏等，直接涂抹在感染部位，每日2 - 3次。
全身用药情况
严重念珠菌感染：当念珠菌感染较为严重，如侵袭性念珠菌病等情况时，可能需要全身用药。氟康唑是常用的全身抗真菌药物之一，对于多数念珠菌感染有较好疗效。但如果是耐氟康唑的念珠菌感染，可能会选用棘白菌素类药物，如卡泊芬净等，卡泊芬净一般首日给予70mg负荷剂量，之后每日给予50mg维持剂量，但具体用药需根据患者病情由医生评估决定。特殊人群用药注意：孕妇发生念珠菌感染时，局部用药相对更安全，如可选用对胎儿影响较小的克霉唑制剂等局部用药，应避免随意使用全身抗真菌药物，除非病情严重经医生权衡利弊后决定。儿童发生念珠菌感染时，局部用药为主，全身用药需非常谨慎，要根据儿童的年龄、体重等因素由医生严格评估后选用合适药物，避免使用不恰当的药物导致不良影响。
用药注意事项
遵医嘱用药：无论是局部用药还是全身用药，都必须严格遵医嘱使用。不能自行随意增减药量或停药，比如局部用克霉唑栓治疗阴道炎，必须按照医生规定的疗程使用，否则可能影响治疗效果，导致病情反复。注意药物不良反应：使用抗真菌药物可能会出现一些不良反应，如使用氟康唑可能会引起胃肠道不适，像恶心、呕吐等；使用棘白菌素类药物可能会有发热、静脉炎等不良反应。在用药过程中如果出现明显不适，应及时告知医生。预防复发：对于容易反复发生念珠菌感染的情况，如外阴阴道假丝酵母菌病容易在月经前后复发的患者，除了规范治疗外，还应注意保持外阴清洁干燥，穿棉质内裤，避免长期使用广谱抗生素、糖皮质激素等，以减少念珠菌感染的复发风险。