如果医生头一天同房，第二天来月经，一般不会怀孕，可能是以下原因导致：
1.安全期：如果女性月经周期规律，在月经来潮前一周内通常属于安全期，此时同房怀孕的几率比较小。
2.子宫内膜脱落：月经是由于子宫内膜脱落引起的，如果同房后第二天来月经，说明子宫内膜已经开始脱落，受精卵无法着床，因此不会怀孕。
3.激素水平变化：同房时女性体内的激素水平会发生变化，但这种变化通常不会影响子宫内膜的脱落和月经的来潮。
需要注意的是，虽然在月经期间同房不会怀孕，但容易引起感染和其他妇科问题。因此，建议在月经期间避免同房，同时注意个人卫生，保持外阴清洁。如果出现月经异常、腹痛、白带异常等症状，应及时就医，以便及时发现和治疗潜在的妇科疾病。