滴虫性龟头炎主要通过药物治疗，一般使用硝基咪唑类药物效果较好，如甲硝唑。通常建议患者连续用药7-10天左右。
药物治疗选择
甲硝唑： 属于硝基咪唑类药物，对滴虫有杀灭作用。它可以通过干扰滴虫的DNA合成，从而抑制其生长繁殖。替硝唑： 也是硝基咪唑类药物，抗菌谱与甲硝唑相似，对滴虫感染引起的龟头炎也有较好的疗效。
日常护理要点
保持局部清洁： 患者要每天用温水清洗龟头部位，保持局部的清洁卫生，避免污垢残留加重感染。清洗时要注意轻柔，避免过度摩擦龟头。避免性生活： 在治疗期间应避免性生活，防止交叉感染，同时也能让龟头炎更好地恢复。如果性伴侣也有相关症状，最好一起检查治疗。
特殊人群注意事项
男性患者： 要注意自身的个人卫生习惯，内裤要勤换，尽量选择宽松、透气的棉质内裤。同时，要避免长期久坐，减少局部的闷热环境。合并其他疾病的患者： 如果患者同时患有糖尿病等基础疾病，要积极控制基础病。因为高血糖环境有利于滴虫生长繁殖，会影响龟头炎的治疗效果。比如糖尿病患者血糖控制不佳时，龟头炎可能反复不愈。