肛周脓肿最好的治疗方法通常是手术治疗，一般在确诊后24-48小时内进行手术效果较好。
手术治疗方式
切开引流术：这是治疗肛周脓肿最常用的手术方法。医生会在脓肿波动最明显的部位切开，使脓液充分引流出来。该手术能快速缓解疼痛等症状，但术后需要定期换药，促进创面愈合。一次性根治术：对于部分低位单纯性肛周脓肿，可采用一次性根治术。这种手术是在切开脓肿引流的同时，找到内口并处理，避免了二次手术的痛苦。不过，手术对医生的技术要求较高。
非手术治疗的辅助情况
抗生素治疗：在脓肿初期，炎症较轻时，可使用抗生素辅助治疗。一般根据脓肿的可能致病菌，选用合适的抗生素，如头孢类抗生素等，但抗生素治疗只能起到控制炎症发展的作用，不能完全治愈肛周脓肿，多数情况下需要结合手术。
术后护理要点
创面清洁：术后要保持肛周创面清洁，每天可用温水坐浴2-3次，每次15-20分钟，这样有助于促进血液循环，减少炎症，利于创面愈合。饮食注意：术后饮食要清淡，多吃富含膳食纤维的食物，如蔬菜、水果等，避免吃辛辣、油腻、刺激性食物，防止便秘或腹泻影响创面恢复。同时要保证充足的水分摄入，每天饮水1500-2000毫升左右，保持大便通畅。