慢性肠炎的治疗需综合多方面因素，一般可通过药物治疗、饮食调整、生活方式改善等来进行。通常药物治疗中会用到一些调节肠道菌群、缓解症状的药物等。
药物治疗方面
调节肠道菌群药物： 比如双歧杆菌四联活菌片，它能调节肠道内的菌群平衡，改善肠道功能，可用于慢性肠炎引起的肠道菌群失调等情况。抗炎药物： 对于一些炎症较明显的慢性肠炎，可能会用到柳氮磺吡啶等药物，它可以起到抗炎的作用，缓解肠道的炎症反应。
饮食调整要点
规律进食： 要养成定时定量进食的习惯，避免暴饮暴食。一般建议每天进食3 - 5餐，每餐七八分饱即可。选择易消化食物： 多吃一些细软、易消化的食物，像小米粥、软面条等。这些食物对肠道的刺激较小，有利于肠道消化吸收，减轻肠道负担。同时要避免吃辛辣、油腻、刺激性强的食物，如辣椒、油炸食品、咖啡、浓茶等，这些食物容易刺激肠道，加重肠炎症状。
生活方式改善
充足睡眠： 保证每天有7 - 8小时的充足睡眠。良好的睡眠有助于身体的自我修复和调节，对肠道功能的恢复也有积极作用。适度运动： 可以进行适度的运动，如散步，每天散步30分钟左右，每周坚持3 - 5次。适度运动能促进肠道蠕动，增强身体的抵抗力，但要注意运动强度不宜过大，避免过度劳累。另外，要注意腹部保暖，尤其是在季节交替或寒冷天气时，避免腹部受凉，因为腹部受凉可能会诱发或加重慢性肠炎的症状。