父亲先天性心脏病有一定遗传倾向，但并非绝对会遗传。研究显示，若父母一方患有先天性心脏病，子女患病风险比普通人群高5% - 10%左右。
先天性心脏病的遗传方式
单基因遗传因素：某些单基因的突变可能导致先天性心脏病。比如，编码心脏离子通道蛋白等相关基因发生突变时，就有引发先天性心脏病的风险。不过这类由单个基因突变导致的情况相对较少见。多基因遗传因素：先天性心脏病大多是多基因遗传相关。是多个基因与环境因素相互作用的结果。父母一方有先天性心脏病，子女携带相关易感基因的概率增加，再加上孕期母亲接触不良环境因素（如感染、接触致畸物质等），就会提高子女患先天性心脏病的几率。
预防与筛查建议
孕期保健很关键：母亲在孕期要避免接触有害物质，如避免接触放射性物质、不要随意滥用药物等。怀孕早期尤其要注意预防病毒感染，像风疹病毒感染就可能增加胎儿患先天性心脏病的风险。母亲应按时进行产前检查，通过超声等检查手段，在孕期早期就关注胎儿心脏发育情况。子女定期检查：有先天性心脏病家族史的子女，建议在儿童时期定期进行心脏检查，比如超声心动图检查。一般建议在婴儿期、幼儿期及儿童期分别进行一次全面的心脏超声筛查，以便早期发现可能存在的心脏结构或功能异常，做到早发现、早干预。
先天性心脏病与环境因素的关系
环境因素的影响：除了遗传因素外，环境因素对先天性心脏病的发生也有重要作用。母亲孕期感染风疹病毒，胎儿患先天性心脏病的风险会显著升高。另外，母亲孕期接触大剂量的射线，也可能增加子女患先天性心脏病的几率。还有，母亲孕期患有糖尿病等疾病，未良好控制病情时，胎儿发生先天性心脏病的可能性也会增加。降低风险的措施：母亲孕期要尽量远离污染环境，保持健康的生活方式，均衡饮食，适量运动。如果母亲本身有基础疾病，如糖尿病等，要积极控制病情，将血糖等指标控制在合理范围内，以降低胎儿患先天性心脏病的风险。