尿道口里面长肉疙瘩，常见原因有尖锐湿疣、女性尿道肉阜、尿道口囊肿、梅毒等，应依据病因作相应处理。男性与女性的常见病因存在一定差异，如中老年女性常见原因是尿道肉阜，男性则多为尖锐湿疣。
一、尖锐湿疣：通过性接触传播，由人乳头瘤病毒感染导致，可在尿道周围出现红色疣体。治疗需综合进行，主要包括去除疣体与防止复发。可局部外用足叶草酯或咪喹莫特，对有蒂或体积较大的疣体必要时可行手术切除，且要男女双方同时治疗。
二、女性尿道肉阜：可能和外阴部慢性炎症、机械性刺激以及雌激素水平降低有关。若无其他症状多数可不治疗。若影响美观或正常生活，可通过电灼、冷冻、激光或手术切除。
三、尿道口囊肿：属于良性疾病，若合并感染会进一步肿大，若不影响外观和排尿一般无需处理，定期观察即可，有影响则需手术完整切除囊肿以免导致排尿困难。
四、梅毒：也是性传播疾病，一期可表现为硬下疳，即外生殖器部位隆起的溃疡和硬结，触感类似肉疙瘩。治疗首选青霉素类，如苄星青霉素或普鲁卡因青霉素，同时要定期进行血液检查以明确治疗效果。
总之，尿道口内长肉疙瘩的原因多样，要明确具体病因后进行针对性治疗。