早晨醒来腰疼一般由生理性原因和病理性原因导致。
一、生理性原因：
1.睡姿不当：人在睡觉时若长期保持不正确姿势，会使腰背部受力过大，导致腰背肌长时间疲劳，进而引发腰肌劳损，造成早晨起床腰疼。对此，建议患者注意睡姿，可选择平躺睡姿，以防加重疲劳。
2.床垫太软：人体有特定生理弯曲，若长期睡过软的床，脊柱中断会呈现下陷情况，腰部肌肉会持续处于紧绷状态，时间一长便可能出现腰疼。所以建议患者睡硬床板，尽量避免睡太软的床。
二、病理性原因：
1.肌肉受凉：患者夜间若着凉，腰背部肌肉收缩，引起血液循环不佳，导致代谢产物堆积并引发炎性反应，有可能出现睡醒后腰疼的情况。这种情况下，建议患者通过热敷来缓解，睡觉时要格外注意保暖。
2.腰椎后关节紊乱症：腰部长期积累的微关节错位可能导致腰后关节功能紊乱并出现疼痛，且其特殊表现为休息不动的时间越长疼痛越明显，所以会出现患者睡醒后腰部疼痛的状况。病情发作时，患者应及时仰卧位休息，可通过推拿、针灸等方式来缓解疼痛。此外，也有可能是腰椎间盘突出等引起疼痛，建议患者及时就医，以免延误病情。
总之，早晨醒来腰疼的原因多样，需根据具体情况进行分析和处理，必要时应及时就医检查和治疗。