小腹刺痛可能由多种原因引起，比如女性生理期时，约有60% - 90%的女性会出现不同程度的小腹刺痛，这是因为生理期子宫收缩等原因导致。
妇科相关原因
子宫内膜异位症： 子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位，就可能引发小腹刺痛。患者还可能伴有痛经进行性加重、月经异常等情况，比如月经量增多、经期延长等。盆腔炎： 女性盆腔内的器官如子宫、输卵管、卵巢等发生炎症时，会出现小腹刺痛，还可能伴有发热、阴道分泌物增多等症状。急性盆腔炎若不及时治疗，可能转为慢性，反复发作。
泌尿系统原因
膀胱炎： 膀胱发生炎症时，会有小腹刺痛感，同时可能出现尿频、尿急、尿痛等症状。一般来说，膀胱炎多见于女性，尤其是性生活活跃期的女性，细菌容易逆行感染膀胱。输尿管结石： 输尿管内有结石时，会引起小腹刺痛，这种疼痛通常比较剧烈，呈绞痛样，还可能伴有血尿，疼痛会向会阴部放射。
肠道原因
肠痉挛： 肠道痉挛时会出现小腹刺痛，可能是由于腹部受凉、进食过多生冷食物等引起。发作时疼痛呈阵发性，可自行缓解。肠炎： 肠道发生炎症时，比如细菌性肠炎，会出现小腹刺痛，还可能伴有腹泻、腹胀、恶心、呕吐等症状。如果是细菌性肠炎，可能与食用了被细菌污染的食物有关。