反复起口疮的原因有多种。一般来说，约20% - 30%的人会受到复发性阿弗他溃疡的困扰，而这与多种因素相关。
一、免疫因素
自身免疫反应异常： 当人体免疫系统出现紊乱时，可能会攻击口腔黏膜组织，从而导致口疮反复发生。例如，在一些自身免疫性疾病患者中，口疮的发生率相对较高。免疫功能低下： 比如艾滋病患者，由于免疫系统受到严重破坏，机体抵抗力大幅下降，就很容易反复出现口疮，而且往往病情较为严重且难以治愈。
二、营养缺乏
维生素缺乏： 尤其是维生素B族缺乏，像维生素B2（核黄素）、维生素B6、维生素B12等缺乏时，会影响口腔黏膜的正常代谢，增加口疮发生的几率。一般人体每天需要摄入一定量的维生素B族，若长期挑食、偏食，就容易导致缺乏。微量元素缺乏： 锌、铁等微量元素的缺乏也与口疮反复有关。锌参与人体多种酶的合成和代谢，缺铁会影响血红蛋白的合成及氧的运输等，这些都会对口腔黏膜的健康产生不利影响，使得口疮反复出现。
三、精神因素
长期压力过大： 现代人生活节奏快，长期处于高压力状态下，会导致神经内分泌功能失调。例如，长期焦虑、紧张、抑郁等情绪会通过神经内分泌系统影响口腔黏膜的血液循环和代谢，进而引发口疮反复。研究发现，长期精神压力大的人群口疮复发的频率明显高于压力较小的人群。睡眠质量不佳： 长期睡眠不足或睡眠质量差，会影响身体的正常修复和调节功能。口腔黏膜的修复需要在良好的睡眠状态下进行，睡眠不好会使口腔黏膜修复不充分，增加口疮反复发生的可能性。