流行性乙型脑炎主要通过蚊虫叮咬传播，其中三带喙库蚊是主要的传播媒介。一般在夏秋季高发，7 - 9月是乙脑的发病高峰期。
蚊虫叮咬是主要传播途径
蚊虫作为传播媒介： 乙脑病毒会在蚊虫体内繁殖，当蚊虫叮咬人时，就会将病毒传播给人。例如，三带喙库蚊吸食了带有乙脑病毒的动物血液后，病毒在蚊体内增殖，再叮咬健康人，就可能导致人感染乙脑病毒。蚊虫的生活习性与传播关联： 蚊虫喜欢在潮湿、有水的环境中滋生，夏季气温高、雨水多，为蚊虫的繁殖提供了有利条件，这也使得乙脑在夏秋季更容易传播。
动物也是潜在的传染源
猪是重要的中间宿主： 猪感染乙脑病毒后，病毒在猪体内大量繁殖，而且猪的感染率较高。猪的数量多、分布广，是乙脑病毒重要的扩散来源。比如，猪感染乙脑后，其血液中会含有大量病毒，当蚊虫叮咬感染乙脑病毒的猪后再去叮咬人，就会将病毒传播给人。其他动物的作用： 马、牛、羊等家畜以及一些鸟类也可能感染乙脑病毒，成为传染源，但相对猪来说，它们在乙脑传播中的作用相对次要一些。
人群易感性与传播的关系
人群普遍易感： 人群对乙脑病毒普遍易感，不过感染后多数人表现为隐性感染，只有少数人会发展为脑炎。儿童由于免疫系统尚未完全发育成熟，相对更容易感染乙脑病毒，而且感染后出现重症的风险可能更高。例如，在乙脑流行地区，儿童感染乙脑病毒的几率相对较高，如果防护不当，就容易发病。