胆管结石的治疗需根据病情等因素综合判断，一般来说，对于无症状的胆管结石，可定期观察；而有症状或并发症的胆管结石，手术治疗是较为重要的方式。手术治疗中，内镜逆行胰胆管造影（ERCP）取石是一种常用方法，对于适合的患者，能在较短时间内解决问题，部分患者通过该方法可有效取出结石。
内镜治疗方式
内镜逆行胰胆管造影（ERCP）： 通过口腔、食管、胃到达十二指肠，找到胆管开口，插入导管将造影剂注入胆管，明确结石位置后，利用取石网篮等工具取出结石。这种方法创伤相对较小，对于合适的胆管结石患者是不错的选择。乳头括约肌切开术： 在ERCP基础上，切开乳头括约肌，便于更大的结石取出，不过术后需注意预防出血、感染等并发症。
手术治疗方式
胆管切开取石术： 适用于较大的胆管结石或伴有胆管狭窄等情况。医生切开胆管，直接取出结石，然后根据情况处理胆管狭窄等问题。该手术能较为彻底地取出结石，但创伤相对ERCP大一些。胆肠吻合术： 当胆管存在严重狭窄等情况时，可能需要将胆管与肠道吻合，以改善胆汁引流。这种手术主要用于复杂胆管结石合并胆管狭窄等情况的治疗。
药物辅助治疗
抗感染药物： 若胆管结石伴有胆管炎，会使用抗感染药物，如头孢菌素类等，控制胆道感染，预防感染进一步加重。但药物治疗不能替代取出结石的根本治疗。利胆药物： 如熊去氧胆酸等，可能有助于胆汁排泄，辅助改善病情，但单独使用往往不能完全解决胆管结石问题。