肛周湿疹可以使用的药物有很多，比如糖皮质激素乳膏、钙调磷酸酶抑制剂等。一般来说，弱效的糖皮质激素乳膏如氢化可的松乳膏可能较为常用，通常每日涂抹2次左右，能在一定程度上缓解瘙痒等症状，但连续使用不宜超过2-3周。
外用糖皮质激素药物
弱效糖皮质激素：氢化可的松乳膏是常见的弱效糖皮质激素外用制剂，它可以通过抑制炎症反应来减轻肛周湿疹引起的瘙痒、红肿等症状。一般适用于皮肤较薄嫩的部位，像肛周皮肤相对较薄的区域。中效糖皮质激素：糠酸莫米松乳膏属于中效糖皮质激素，抗炎作用比弱效的更强一些，但使用时也要注意疗程，通常连续使用不要超过2-4周，以免引起皮肤萎缩等不良反应。
钙调磷酸酶抑制剂
他克莫司软膏：对于不宜使用糖皮质激素的部位或者面部、肛周等皮肤部位的肛周湿疹可以选用他克莫司软膏。它通过抑制钙调磷酸酶的活性来发挥免疫抑制作用，从而缓解湿疹症状。一般开始使用时可能会有短暂的灼热感，但多数人可以耐受。吡美莫司乳膏：吡美莫司乳膏的作用机制与他克莫司类似，也是通过调节免疫反应来改善肛周湿疹的症状。同样适用于轻至中度的肛周湿疹患者，尤其适合面部、间擦部位等皮肤薄嫩处。
收敛止痒药物
氧化锌软膏：氧化锌软膏有收敛、保护皮肤的作用，还能轻度止痒，对于肛周湿疹伴有渗出不多的情况可以使用。它可以在肛周皮肤形成一层保护膜，减少外界刺激对皮肤的影响。炉甘石洗剂：如果肛周湿疹没有明显渗出时，炉甘石洗剂也可以使用，它能起到止痒的作用。使用前需要摇匀，然后涂抹在肛周患处，不过如果皮肤有破损就不能用了。