非经期褐色分泌物腰疼，可能与以下几种原因有关：
1.排卵期出血：如果非经期出现在两次月经中间，可能是排卵期出血。这是由于排卵后雌激素水平下降，引起子宫内膜脱落，导致少量出血。排卵期出血通常持续2-3天，出血量较少，有时会伴有腰部酸痛、腹痛等症状。
2.内分泌失调：长期的精神压力、情绪波动、熬夜等因素，可能导致内分泌失调，影响激素水平，从而引起非经期褐色分泌物和腰疼。
3.妇科炎症：如阴道炎、宫颈炎、盆腔炎等，可能导致阴道分泌物异常，伴有腰疼、腹痛等症状。
4.子宫内膜息肉：子宫内膜息肉可能导致非经期出血和腰疼。
5.其他：放置宫内节育器、子宫内膜异位症、宫颈癌等也可能引起类似症状。
如果出现非经期褐色分泌物和腰疼，建议及时就医，进行相关检查，如妇科检查、B超等，以明确原因，并采取相应的治疗措施。以下是一些可能的治疗方法：
1.排卵期出血：一般不需要特殊治疗，注意休息，保持心情愉悦即可。
2.内分泌失调：调整生活方式，保持充足的睡眠，缓解压力，可在医生的指导下使用药物调节内分泌。
3.妇科炎症：根据炎症的类型，使用抗生素、抗真菌药物等进行治疗。
4.子宫内膜息肉：通常需要手术切除息肉。
5.其他：根据具体情况进行相应的治疗，如放置宫内节育器取出、药物或手术治疗子宫内膜异位症、手术治疗宫颈癌等。
此外，在治疗期间，应注意个人卫生，保持外阴清洁，避免性生活，以免加重病情。同时，应遵循医生的建议，按时服药或进行治疗，并定期复查，以确保治疗效果。如果症状持续不缓解或加重，应及时复诊。