肛门连着小肚子疼可能是肠炎、尿路结石、细菌性痢疾等疾病引起，需到医院检查医治。
一、肠炎：多由细菌感染导致，会使肠道出现炎症反应。其主要症状除了肚子疼痛，往往还伴有腹泻。治疗上可配合医生使用阿莫西林胶囊、蒙脱石散等药物。阿莫西林胶囊能起到抗菌消炎作用，蒙脱石散可缓解腹泻症状。
二、尿路结石：可由代谢异常或不良饮食习惯引发。结石会刺激尿道，从而引起小腹部疼痛。患者可通过多喝水以及多运动来促进结石排出。
三、细菌性痢疾：由志贺菌感染引起，且具有传染性。治疗可在医生指导下服用阿奇霉素片、左氧氟沙星片等药物。
此外，也可能是痔疮、肛裂、溃疡性结肠炎、肠道肿瘤等因素导致，应尽早就医。总之，当出现肛门连着小肚子疼的情况时，要及时就医明确原因，并采取针对性的治疗措施。