口腔溃疡目前并没有绝对的“特效药”，但有一些药物可以缓解症状、促进愈合。一般来说，局部用药较为常用，比如复方氯己定含漱液，它能起到抗菌消炎的作用，可在口腔溃疡发作时用来含漱，每次含漱10 - 15分钟左右。
局部外用药物类
含漱剂：除了复方氯己定含漱液，还有呋喃西林含漱液，它能清洁口腔，抑制细菌生长，帮助减轻口腔溃疡的炎症反应。使用时同样是含漱，每次含漱时间约1分钟左右。散剂：冰硼散是比较常见的散剂，它有清热解毒、消肿止痛的功效，直接撒在口腔溃疡面上，能缓解疼痛、促进愈合。不过儿童使用时要注意避免误吞。
促进愈合类药物
重组人表皮生长因子凝胶：它能促进口腔黏膜上皮细胞的增殖、迁移，加快溃疡面的愈合。使用时轻轻涂抹在溃疡部位，一天可以使用2 - 3次。但要注意，对该药物过敏者禁用。康复新液：它可以修复溃疡创面，调节免疫功能。既可以含漱，也可以用纱布湿敷在溃疡处。含漱时一次10毫升左右，含漱5分钟后吐出；湿敷时每次用纱布浸透药液，敷在溃疡处。
缓解疼痛类药物
利多卡因凝胶：这是一种局部麻醉药，能起到暂时止痛的作用。在口腔溃疡疼痛明显时使用，涂抹在溃疡表面，但不能频繁使用，以免产生依赖。孕妇及对酰胺类局麻药过敏者禁用。苯佐卡因凝胶：也有类似的止痛效果，涂抹后能快速缓解口腔溃疡带来的疼痛，但同样不建议长时间或大量使用，儿童使用需谨慎。口腔溃疡的治疗还需要注意保持口腔清洁，饭后及时漱口，避免食用辛辣、刺激性食物等。如果口腔溃疡反复发作、持续不愈合或者溃疡面较大较严重，应及时就医，排查是否有其他系统性疾病等因素，而不能单纯依赖药物，要在医生的指导下进行综合治疗。