不存在小儿秋季腹泻最佳治疗方法这一说法，一旦发现患病应尽快前往当地正规医院的小儿消化科进行诊治，要在医生指导下实施治疗举措，切不可自行用药，以免加重腹泻或引发其他不适症状。具体如下：
一、一般治疗：
1.要适当为小儿增添衣物，避免其受凉，从而防止因胃肠道不适而加重秋季腹泻症状。
2.要增加温水的摄入量，以满足机体的需求。
二、药物治疗：
小儿秋季腹泻多数是由轮状病毒感染所引起，需有针对性地进行医治。
1.可以在医生指导下使用药物，如蒙脱石散、双歧杆菌三联活菌肠溶胶囊等，能起到保护肠黏膜以及平衡肠道菌群的作用。
2.同时进行口服补液治疗，推荐使用标准枸橼酸钠口服补液盐，对于轻中度脱水的小儿需要先将脱水量补足，然后继续维持补液；用于预防脱水时，可在每次腹泻后进行补液，直至症状停止。口服补液可能会出现轻度的恶性、呕吐等不良反应，饭后服用可减轻对胃的刺激。
由于小儿秋季腹泻主要集中爆发于秋冬季节，其主要易感人群为6个月至2岁的婴幼儿，且年龄越小发作几率越大，所以必须及时采取有效的治疗来控制症状，避免出现诸如发热、脱水、电解质紊乱、休克等其他并发症，以免导致营养不良、生长发育迟缓等后果。