宝宝病毒性感冒反复发烧39度三天，可能是由以下原因引起的：
1.病毒感染：病毒性感冒是由病毒引起的呼吸道感染，常见的症状包括发热、咳嗽、流鼻涕等。宝宝感染病毒后，免疫系统会产生反应，导致体温升高。
2.免疫力低下：宝宝的免疫系统尚未完全发育成熟，可能更容易受到病毒的侵袭。如果宝宝的免疫力较低，可能会导致病毒感染持续时间较长，发烧也更难控制。
3.并发症：在某些情况下，病毒感染可能会导致一些并发症，如肺炎、中耳炎等。这些并发症可能会导致发烧持续时间延长。
4.药物反应：某些抗病毒药物可能会导致宝宝出现发热等不良反应。如果宝宝正在服用抗病毒药物，需要注意观察是否是药物引起的发烧。
针对这种情况，以下是一些建议：
1.观察宝宝的症状：除了发烧外，还需要观察宝宝的精神状态、呼吸情况、饮食情况等。如果宝宝出现精神萎靡、呼吸急促、食欲不振等症状，需要及时就医。
2.给宝宝适当的护理：可以给宝宝多喝水，以保持身体水分；使用温水擦拭身体，帮助降低体温；注意保持宝宝的皮肤清洁和干燥。
3.按照医生的建议使用退烧药：如果宝宝的体温超过38.5度，可以使用退烧药，如布洛芬或对乙酰氨基酚。需要按照医生的建议使用药物，不要自行增减剂量。
4.及时就医：如果宝宝的发烧持续时间较长，或者出现其他异常症状，需要及时就医。医生会进行详细的检查和诊断，并根据情况给予相应的治疗。
5.注意隔离：在宝宝生病期间，需要注意隔离，避免交叉感染。家长和其他家庭成员要勤洗手，保持室内通风。
6.遵循医生的建议：在治疗过程中，需要遵循医生的建议，按时服药、复诊等。如果有任何疑问或担忧，及时与医生沟通。
需要注意的是，每个宝宝的情况都不同，如果对宝宝的病情有任何疑虑，最好及时咨询医生的意见。