宝宝病毒感染发烧三天仍未退，原因可能是病情未有效控制。以下是具体应对措施：
一、药物治疗
1.可在医生指导下给宝宝服用抗病毒口服液或小儿豉翘清热颗粒等药物。
2.体温情况处理：
(1)若体温在36℃到37℃之间，可采用物理降温，用热毛巾擦拭宝宝额头、颈部、腋窝、四肢躯干以及腹股沟等血管丰富部位，利于散热。
(2)体温超过38.5℃以上，应遵医嘱口服布洛芬颗粒、对乙酰氨基酚泡腾颗粒等退烧药。
二、进一步检查
若病情严重，建议及时带宝宝至正规医院进行C反应蛋白、血常规、支原体及尿常规等相关检查，同时做肺部CT或胸片等辅助诊断，以尽早明确病因并治疗。
三、其他注意事项
治疗期间应让宝宝多喝温开水，以促进身体新陈代谢。
总之，当宝宝出现病毒感染发烧三天未退的情况时，要根据具体情况采取合适的治疗和护理措施，及时就医检查明确病因，帮助宝宝尽快康复。