急性角膜炎、结膜炎常用的眼药水有抗生素类、抗病毒类以及糖皮质激素类等。一般来说，细菌性急性角膜炎、结膜炎常选用抗生素眼药水，比如左氧氟沙星滴眼液，它能抑制细菌DNA旋转酶，从而阻碍细菌DNA复制，起到杀菌作用；而病毒性急性角膜炎、结膜炎则需用抗病毒眼药水，像更昔洛韦滴眼液，它可竞争性抑制病毒DNA多聚酶，并掺入病毒及宿主细胞的DNA中，阻止病毒DNA合成。
抗生素类眼药水
细菌性感染常用： 左氧氟沙星滴眼液是比较常用的，它对引起眼部细菌感染的常见病菌有较好的抑制作用。使用时要注意，对喹诺酮类药物过敏者禁用。一般来说，细菌性急性结膜炎患者使用这类眼药水后，症状能在几天内有所缓解。妥布霉素滴眼液： 也是针对细菌感染的眼药水，适用于敏感细菌引起的外眼及附属器的局部感染。儿童使用时要谨慎，需在医生指导下使用。
抗病毒类眼药水
更昔洛韦滴眼液： 主要用于治疗病毒性角膜炎、结膜炎等。它通过干扰病毒DNA合成来发挥抗病毒作用。使用时可能会出现一些不良反应，如眼部刺痛等，若出现严重不适要及时停药就医。阿昔洛韦滴眼液： 同样是针对病毒感染的眼药水，对单纯疱疹病毒性角膜炎等有一定疗效。在使用过程中要注意观察眼部反应，孕妇及哺乳期妇女使用需咨询医生。
糖皮质激素类眼药水
氟米龙滴眼液： 这类眼药水具有抗炎作用，但不能随意使用。一般在炎症较严重且排除感染因素后，在医生的严格评估下使用。比如一些免疫性因素导致的急性结膜炎，可能会用到，但长期使用可能会引起眼压升高等副作用，所以使用期间要定期监测眼压。醋酸泼尼松龙滴眼液： 也是糖皮质激素类，主要用于治疗对糖皮质激素敏感的眼部炎症，像结膜炎、角膜炎等。使用时要遵循医生的疗程，不能自行增减药量。需要注意的是，急性角膜炎、结膜炎患者在使用眼药水时，要先清洁双手，避免污染眼药水。同时，不同病因引起的炎症需要针对性用药，不能自行盲目用药，最好在医生的明确诊断后选择合适的眼药水，并且要按照医生的要求规范使用。