牙齿两边最里面疼痛可能是由以下疾病导致：
一、阻生智齿：这通常是由于智齿萌出时受到颌骨退化、萌出角度不当、局部病变等因素影响。具体表现为：
1.患者往往会出现牙龈疼痛以及牙龈红肿等症状，进而呈现出牙齿两边最里面疼痛的情况。
二、智齿冠周炎：一般是由智齿萌出不足、细菌感染等引起，且和疲劳、精神紧张、口腔卫生不良等因素有关。其症状如下：
1.慢性智齿冠周炎多数没有明显症状，仅存在轻度疼痛症状。
2.急性智齿冠周炎患者则会有牙区肿胀、吞咽痛、进食痛等表现，也会出现牙齿两边最里面疼痛的状况。
三、牙髓炎：一般是因细菌感染导致，还和重度牙周炎、强烈撞击等因素相关。患者的症状为：
1.牙齿疼痛，呈现放射性痛、温度刺激痛、夜间痛等。
2.如果是牙齿两边最里面发生牙髓炎，就会表现为牙齿两边最里面疼痛，同时还会伴有头痛、脸痛等现象。
建议患者日常要多加注重口腔卫生，一旦出现疼痛等不适症状，需及时就医检查并进行针对性治疗。