温州男科医院比较好的包括温州医科大学附属第一医院、温州医科大学附属第二医院以及温州市中医院。
一、温州医科大学附属第一医院：此医院创建于1919年，属于浙江省首批通过三甲评审的四家综合性医院之一，其医疗服务可辐射浙南闽北赣东将近3000万人口。该医院在中国医院科技影响力排行榜（综合）中位列第68位，有27个学科进入全国学科科技影响力百强，在全国三级公立医院绩效考核里排名全国第24位。具体来说，医院科室齐全，医疗技术先进，拥有众多优秀的医护人员，在男科疾病的诊断和治疗方面积累了丰富的经验。
二、温州医科大学附属第二医院：温州医科大学附属第二医院以及育英儿童医院是浙江省属的三甲综合性医院，始建于1976年。医院现设置了14个学科（系），89个科室（教研室），186个亚专科，130多个专科门诊。现具备1个国家临床重点专科、1个国家中医药管理局重点建设专科；4个省重中之重临床医学一级学科专业方向、2个省高等学校重点扶植学科和重点专科等等。在男科领域，其有着专业的医疗团队和先进的诊疗设备，能够为患者提供高质量的医疗服务。
三、温州市中医院：温州市中医院创立于1923年，如今是国家三级甲等中医医院，也是全国“文明单位”、省级“平安医院”、“绿色医院”，承担着浙南地区中医医疗、教学、科研、培训、养生、保健等任务。医院的学科在地区辐射性很强，目前拥有4个国家级重点专科，9个省中医重点学（专）科，4个市级重点学科群，8个市级重点学科，始终保持着在地区中医药发展建设中的领先地位。对于男科疾病，能运用中医特色疗法进行有效的诊治和调理。
总之，患者可以根据自身需求自行选择合适的医院就诊。