13价肺炎疫苗常见的副作用一般比较轻微，多数在接种后2-3天内出现。比如局部可能出现红肿、疼痛，发生率相对较低，一般在10%左右；也可能出现发热，多数为低热，体温通常在38.5℃以下，持续时间较短，大多1-2天就会缓解。
局部副作用表现
接种部位红肿：接种后少数宝宝接种部位会出现红肿情况，一般红肿范围比较小，直径多在2-5厘米左右，通常不需要特殊处理，保持局部清洁干燥，2-3天会自行消退。接种部位疼痛：有些宝宝会感到接种部位疼痛，不过这种疼痛一般比较轻微，多数宝宝可以耐受，不需要用止痛药物，通过转移注意力等方式大多能缓解。
全身副作用表现
低热：接种13价肺炎疫苗后，约有10%-30%的宝宝可能出现低热，体温一般在37.5-38.5℃之间，这种低热持续时间较短，多数1天内体温可恢复正常。烦躁不安：部分宝宝可能会出现烦躁不安的情况，这可能是因为身体有轻微不适导致的，家长可以多安抚宝宝，给宝宝创造舒适的环境，一般1-2天宝宝的情绪会恢复正常。
罕见严重副作用情况
虽然非常罕见，但也有报道出现过敏反应，如皮疹、呼吸困难等。如果宝宝接种后出现呼吸急促、面色苍白、口唇发紫、全身大片皮疹等严重情况，需要立即就医。另外，极少数宝宝可能出现高热持续不退（体温超过38.5℃且持续时间超过2天），也需要及时带宝宝到医院就诊，排查是否有其他问题。不过整体来说，13价肺炎疫苗的副作用发生概率较低，而且多数是轻微的，接种疫苗能有效预防肺炎球菌感染相关疾病，其益处远远大于可能出现的副作用风险。