宝宝吃奶咳嗽的原因包括喂奶方式不当、上呼吸道感染、气管食管瘘等。具体如下：
一、喂奶方式不当：若奶瓶奶嘴的出奶孔较大，或妈妈乳头的出奶速度较快等，都可能使宝宝被呛到，进而出现吃奶咳嗽现象。对此，可以更换出奶孔较小的奶瓶进行喂奶，从而避免宝宝吃奶时咳嗽。
二、上呼吸道感染：当宝宝着凉后，细菌或病毒侵入呼吸道引发感染，会有鼻塞、咳嗽等症状，这也会导致吃奶咳嗽。如果宝宝症状较轻，通常无需吃药治疗，感冒可能会自行痊愈。但若是症状明显，则可遵医嘱使用抗感颗粒等药物进行医治。
三、气管食管瘘：由于宝宝气管食管先天性发育不良，致使食管和气管间存在瘘口，吃奶时奶液会流进气管，引起反射性咳嗽，从而出现宝宝吃奶咳嗽的情况。若明确诊断为气管食管瘘，可在医生指导下进行手术治疗。
总之，当宝宝吃奶咳嗽时，应及时查找原因，并采取相应的处理措施。