扁桃体结石可以通过一些方法弄出来，比如较小的结石可以尝试用清水或淡盐水漱口来清理，不过这可能效果有限。一般来说，对于不太严重的扁桃体结石，首先可以尝试自我清理。
家庭简易清理法
用棉签轻轻擦拭：如果能看到比较小的结石，可以用消毒过的棉签轻轻去擦拭扁桃体表面，尝试把结石弄出来，但要注意动作轻柔，避免损伤扁桃体。不过这种方法对于较深的结石可能效果不佳。使用盐水漱口：每天用温盐水多次漱口，浓度大概是一杯温水加半茶匙盐。盐水有一定的清洁作用，可能会帮助松动一些较小的扁桃体结石，使其更容易被清理出来，但也不能保证一定能把结石弄出来。
就医由医生处理
医生用镊子夹取：如果自己处理不了，患者可以去医院，医生会使用专门的镊子等工具，在直视下将扁桃体结石夹取出来。这种方法相对比较直接，能较快速地把结石弄出来，但患者可能会有一定的不适感。医生用吸引器吸出：对于位置较深或者较大的结石，医生还可能会使用吸引器等设备将结石吸出。这需要医生有一定的操作技巧，能准确地将结石吸出。
预防为主减少结石产生
保持口腔清洁：每天至少刷牙两次，使用正确的刷牙方法，每次刷牙时间不少于3分钟，同时还可以使用牙线清理牙缝，这样能减少口腔内细菌等物质的残留，降低扁桃体结石产生的几率。比如每天早晚都要认真刷牙，饭后也尽量漱口。多喝水：每天保证摄入足够的水分，大概1500 - 2000毫升左右，保持口腔湿润，有助于冲刷口腔和扁桃体表面，减少分泌物等堆积形成结石。