40天宝宝嗓子哑了，可通过药物、饮食、物理等方式来治疗，具体如下：
一、药物
1.如果是急性扁桃体炎导致的，可使用利巴韦林颗粒、头孢克洛颗粒等药物进行治疗，这些药物能起到较好的消炎作用。同时，也可使用羚翘解毒丸、清咽利膈丸等中成药物，也会有不错的效果。
2.但需注意药物的使用要严格遵循医嘱，尤其是对于这么小的宝宝，要确保用药的安全性和合理性。
二、饮食
1.可以通过调整饮食来辅助治疗，比如给宝宝喝冰糖炖雪梨，能起到润肺润喉的作用。
2.也可以喂食银耳莲子粥等。同时，要让宝宝多吃粗粮、水果蔬菜等，避免吃辛辣、刺激的食物，这样有利于宝宝症状的逐渐缓解。
三、物理
1.当宝宝嗓子哑时，可以给宝宝咽喉部位进行适当的按摩和热敷等物理方式，能使宝宝的嗓子得到放松。
2.同时要注意给宝宝多喝水，有助于改善症状。
总之，对于40天宝宝嗓子哑的情况，要综合运用多种方法进行治疗和护理，密切关注宝宝的状态变化，如有异常应及时就医。