怀孕初期小便后纸上有褐色分泌物，意味着存在少量出血，其原因可能包括着床出血、先兆流产以及其他因素。
一、着床出血。如果月经尚未推迟或者刚刚推迟，此时出现的少量褐色分泌物，大概率是胚胎在子宫内膜着床过程中引发的少量出血现象。着床出血通常出血量较少，持续时间较短，一般不会伴有其他明显不适症状。
二、先兆流产。若同时伴有肚子疼痛以及下坠感等情况，那么就很有可能是先兆流产导致的出血。这种情况下，需要尽快前往医院进行B超检查和孕酮检测等，以便明确诊断和采取相应的治疗措施。
三、其他原因。少量出血也有可能是其他一些原因所造成，比如盆腔炎、泌尿系感染、结石等。当出现这种情况时，也应及时到医院进行相关检查，以明确具体原因并进行针对性的处理。
总之，怀孕初期出现小便后纸上有褐色分泌物的情况，需要引起重视并及时就医，通过相关检查明确原因，以便采取恰当的处理措施。