乙肝治疗中并没有绝对意义上“最好”的药，要根据患者具体病情等因素来选择合适药物。目前常用的抗乙肝病毒药物有核苷（酸）类似物和干扰素两类。比如恩替卡韦属于核苷（酸）类似物，它能抑制乙肝病毒复制，一般需要长期服用，部分患者服用后病毒载量能得到有效控制，但具体疗效因个体差异而异。
核苷（酸）类似物类药物
恩替卡韦： 它对乙肝病毒多聚酶具有抑制作用，可有效抑制病毒复制。不过，孕妇、哺乳期女性使用需谨慎评估风险。替诺福韦酯： 也是常用的核苷（酸）类似物，能抑制乙肝病毒反转录酶，从而发挥抗病毒作用。但肾功能不全者使用时要密切监测肾功能指标。
干扰素类药物
普通干扰素： 可以调节机体免疫功能来发挥抗病毒作用，一般需要每周注射几次，疗程相对固定。不过，使用普通干扰素可能会出现流感样症状等不良反应，如发热、乏力等，而且患有严重心脏病、癫痫等疾病的患者通常不适合使用。聚乙二醇干扰素： 是长效干扰素，每周注射一次即可。它的抗病毒效果和普通干扰素有一定差异，相对来说起效可能有一定特点，但同样也存在如血液学指标改变等不良反应，使用前需要进行全面评估。
用药需考虑的特殊情况
儿童患者： 儿童乙肝患者用药需格外谨慎，要根据儿童的年龄、体重等情况在医生指导下选择合适的药物，比如一些核苷（酸）类似物在儿童中的使用剂量和安全性需要严格把控。老年患者： 老年乙肝患者往往可能伴有其他基础疾病，在选择药物时要考虑药物之间的相互作用以及对肝肾功能的影响等，比如替诺福韦酯对于肾功能已有损伤的老年患者可能需要调整用药方案。肝硬化患者： 肝硬化患者使用抗乙肝病毒药物时，要关注药物对肝脏功能的进一步影响以及是否会加重肝硬化相关并发症等情况，医生会综合多方面因素来权衡用药。