神经性偏头痛的症状主要有以下表现。一般来说，神经性偏头痛发作时，头痛部位多为单侧头部，约有60%的患者是单侧头痛。
疼痛特点方面
搏动性疼痛： 疼痛通常呈搏动样，就像心脏跳动一样有节奏地疼痛，有的患者会感觉头部血管在随着心跳一下一下地跳痛。持续时间不定： 发作持续时间可长可短，短则数小时，长则可达数天。有的患者可能发作一次持续2 - 3小时就缓解了，而有的患者可能会持续1 - 2天。
伴随症状方面
恶心呕吐： 约有一半以上的神经性偏头痛患者会伴有恶心症状，严重时还会出现呕吐。有些患者是先感觉恶心，然后才开始头痛发作，或者头痛发作过程中出现呕吐。畏光畏声： 患者在发作时往往怕光，见到强光会觉得不适，同时也怕声音，处于嘈杂环境中会让头痛加重。比如在明亮的房间里会觉得刺眼，听到说话声、电视声等会让头痛更明显。
发作频率方面
发作频率差异大： 有的患者可能几个月发作一次神经性偏头痛，而有的患者可能一个月会发作好几次。一些女性患者在月经前后更容易发作，这可能与体内激素变化有关。比如有研究发现，在月经周期中，雌激素水平的波动可能会诱发神经性偏头痛的发作。