幼儿急疹主要是由人类疱疹病毒6型（HHV-6）引起的，约占幼儿急疹病因的90%，其次是人类疱疹病毒7型（HHV-7），占比约5%。
病毒感染是主因
人类疱疹病毒6型感染： 幼儿急疹大部分是由人类疱疹病毒6型初次感染所致。这种病毒具有嗜淋巴细胞性，会在人体的淋巴细胞内繁殖，从而引发一系列免疫反应，最终导致幼儿急疹的发生。一般来说，6-24个月的婴幼儿是人类疱疹病毒6型感染引发幼儿急疹的高发人群。人类疱疹病毒7型感染： 人类疱疹病毒7型也是引起幼儿急疹的常见病原体之一。它同样会侵袭婴幼儿的机体，导致免疫系统被激活，使得幼儿出现发热、皮疹等幼儿急疹的典型症状。不过，相较于人类疱疹病毒6型，人类疱疹病毒7型引起幼儿急疹的比例相对低一些。
传播途径特点
密切接触传播： 病毒可以通过密切接触进行传播。比如，被感染的幼儿的唾液、呼吸道分泌物中含有病毒，当健康儿童与患病儿童一起玩耍、亲吻或者共用玩具等密切接触时，就有可能接触到这些含有病毒的分泌物，从而感染病毒引发幼儿急疹。飞沫传播： 人类疱疹病毒6型和7型还可以通过飞沫传播。当感染病毒的幼儿咳嗽、打喷嚏时，会产生含有病毒的飞沫，这些飞沫在空气中悬浮，健康幼儿吸入后就有可能被感染。在托儿所、幼儿园等幼儿集中的场所，飞沫传播的风险相对较高。
婴幼儿自身因素
免疫系统发育不完善： 婴幼儿的免疫系统还处于发育阶段，相对较弱。对于病毒的抵御能力较差，当人类疱疹病毒6型或7型入侵时，婴幼儿的免疫系统难以迅速有效地将其清除，就容易引发感染并发展为幼儿急疹。一般来说，1岁以内的婴儿免疫系统更为脆弱，是幼儿急疹的高发年龄段。体温调节不稳定： 婴幼儿的体温调节中枢尚未发育成熟，在感染病毒后，体温容易出现较大波动。感染人类疱疹病毒6型或7型后，常常会先出现高热症状，体温可迅速升高到39℃甚至更高，而这种不稳定的体温变化也与幼儿急疹的发生和发展有一定关系。高热持续一定时间后，体温会突然下降，随后出现皮疹，这也是幼儿急疹的典型表现之一。