扁桃体发炎时常用的消炎药有青霉素类、头孢菌素类等，但不存在绝对最好的药，需根据病情等选择。一般来说，青霉素类如阿莫西林较为常用，若是对青霉素过敏，可考虑头孢菌素类药物，如头孢克洛等。
青霉素类消炎药
阿莫西林： 属于广谱青霉素类抗生素，对多数引起扁桃体发炎的细菌有较好的抗菌作用。它通过抑制细菌细胞壁的合成发挥杀菌作用。一般来说，成人常用剂量是一次0.5克，每8小时一次，但具体使用需遵医嘱。哌拉西林： 也是青霉素类的一种，对一些革兰阴性菌等有较好的抗菌活性，可用于较为严重的扁桃体发炎情况，但使用前需做皮试，确认无过敏后才可使用。
头孢菌素类消炎药
头孢克洛： 属于第二代头孢菌素，对多种细菌有抗菌作用，对扁桃体发炎常见的致病菌有一定疗效。成人一般一次0.25克，一日3次，小儿按体重计算剂量。头孢呋辛： 第二代头孢菌素，抗菌谱较广，可用于治疗扁桃体发炎。有口服制剂和注射制剂，口服时成人一般一次0.25克，一日两次，严重感染时剂量可加倍。
大环内酯类消炎药
阿奇霉素： 属于大环内酯类抗生素，对支原体、衣原体等有较好的作用，也可用于扁桃体发炎的治疗。成人常用剂量是第一天0.5克顿服，然后第2 - 5天一日0.25克，小儿剂量根据体重计算。罗红霉素： 大环内酯类抗生素，对革兰阳性菌、厌氧菌等有抗菌活性，可用于扁桃体发炎。成人一般一次150毫克，一日2次，空腹服用效果较好。需要注意的是，使用消炎药前要确定没有药物过敏史，而且用药要在医生的指导下进行，不能自行随意用药。如果扁桃体发炎反复发作，可能还需要考虑其他治疗方法，如手术切除扁桃体等，但这是在药物治疗效果不佳等情况下才会考虑的。