子宫内膜异位的常见原因包括：一、种植学说，即经血逆流导致内膜种植。在月经期，经血通常是从宫口、阴道顺流排出体外，但会有小部分经血或因其他因素夹杂着脱落的子宫内膜碎片，经输卵管道流入腹腔，进而种植在盆腔脏器表层形成子宫内膜异位病灶。二、化生内膜，如浆膜上皮化生内膜。在人体胚胎发育时期，卵巢表面上皮、腹膜、阴道直肠膈、脐部等均由体腔上皮化生而来，这些组织在性腺激素、炎症、机械因素刺激下能够转化形成另一种组织，也可化生为子宫内膜。三、良性转移，通过血液、淋巴实现良性转移。像出现在肺部、脑膜、心包、四肢及其他远端的子宫内膜异位症，就是通过血液循环或淋巴系统将子宫内膜碎屑转移并停留在某脏器或组织上从而发病。四、医源性的内膜移植，这是人为造成的子宫内膜移植到某些部位，常见于剖宫产术、早期中期妊娠刮宫术、分娩时会阴侧切术、人工流产术等过程中。五、免疫防御功能缺陷，随经血逆流至腹腔的子宫内膜如同异物，会激活体内免疫系统，若体内免疫功能存在缺陷，就可能发展成子宫内膜异位症。六、遗传因素，子宫内膜异位症具有一定的遗传倾向和家族聚集性，有家族病史的人更容易患此病。
总之，子宫内膜异位的形成原因较为复杂多样，涉及种植、化生、转移、医源性操作、免疫以及遗传等多个方面。