通常情况下，患者出现小便疼痛且伴有脓液流出的情况，很可能是淋菌性尿道炎导致的。对此可在医生指导下，通过一般治疗、药物治疗等方式来处理。淋菌性尿道炎的治疗办法如下：
一、一般治疗：
1.患者应适度休息，避免进食生冷及刺激性食物。
2.每日清洗尿路部位，并保持其干燥状态。
3.在治疗期间应尽可能避免性接触，以防交叉感染。
二、药物治疗：
患者需在医生指导下用药，切不可自行用药。常用药物包括四环素、阿奇霉素、左氧氟沙星、环丙沙星、甲硝唑等。淋菌性尿道炎的病因包含：
1.致病菌：主要是淋球菌，其可侵入男性前尿道、女性尿道，通过表面菌毛黏附在尿道细胞表面。
2.诱发因素：如不洁性生活、自身免疫力低下、外伤感染等都可能引发淋菌性尿道炎。然而，小便疼痛且有脓液流出也可能存在其他原因，所以建议及时前往医院就诊，完善检查以明确病因后，给予针对性的处置或治疗。
总结：当患者出现小便疼痛伴脓液流出时，可能是淋菌性尿道炎，可根据具体情况采取一般治疗和药物治疗，同时还需考虑其他病因，应及时就医明确诊断并治疗。