正露丸和整肠丸都是由中药加工而成，主要用于治疗胃肠部疾病，它们在外观、功效、组成、临床运用、注意事项等方面存在区别。
一、外观：
正露丸呈现为黑棕色稍软的丸剂；整肠丸则为棕褐色丸剂。
二、功效：
1.正露丸具有收湿泻热、定痛止血、生津化痰、生肌止泻等功效。
2.整肠丸主要有温里健脾、宽胸止呕、镇痛止泻等功效。
三、组成：
1.正露丸由木榴油、阿仙粉、黄柏、甘草、陈皮等中药组成。
2.整肠丸包含黄柏、丁香、肉桂、陈皮、甘草等中药。
四、临床运用：
1.正露丸临床上可用于治疗因湿热、食滞引发的食欲不振、恶心呕吐、腹胀腹泻等，还能用于蛀牙引起的牙痛。
2.整肠丸适用于因消化不良、水土不服和食物不洁导致的胃肠不适、腹痛腹胀、呕吐泄泻等。
五、注意事项：
1.正露丸药性偏寒，脾胃虚弱者不宜服用，患有心脏病、肝病、消渴病、肾病等慢性病的患者需在医生指导下服用。
2.整肠丸禁用于癃闭、青光眼患者以及哺乳期妇女和孕妇。
总之，正露丸和整肠丸虽然都对胃肠疾病有一定疗效，但在诸多方面存在差异，使用时需根据具体情况进行合理选择和注意相关禁忌。