保济丸和整肠丸都是常见的肠胃用药，它们的区别主要体现在以下几个方面：
1.成分不同：保济丸的主要成分有钩藤、菊花、蒺藜、厚朴、木香、苍术、天花粉、广藿香、葛根、化橘红、白芷、薏苡仁、稻芽、薄荷、茯苓、广东神曲；而整肠丸的主要成分有颠茄提取物、肉桂、丁香、甘草、木馏油、水杨酸苯酯、薄荷脑。
2.功效不同：保济丸具有解表、祛湿、和中的功效，主要用于治疗暑湿感冒、发热头痛、腹痛腹泻、恶心呕吐、肠胃不适；整肠丸则具有温中和胃、理气止痛的功效，主要用于治疗邪滞中焦所致的恶心、纳差、胃痛、腹痛、胃胀、腹胀、泄泻等症。
3.适用人群不同：保济丸适用于成人和儿童，一般在饭前服用；整肠丸适用于成人，一般在饭后服用。
4.不良反应不同：保济丸的不良反应尚不明确；整肠丸的不良反应主要有口干、便秘、出汗减少、口鼻咽喉及皮肤干燥、视力模糊、排尿困难（老人）等。
需要注意的是，以上信息仅供参考，具体用药请在医生或药师的指导下进行。同时，在使用任何药物之前，都应该仔细阅读药品说明书，了解其用法用量、不良反应、禁忌等信息。