宝宝早晨起来咳嗽有痰，可能与支气管炎、小儿肺炎、上呼吸道感染等有关。
一、支气管炎：
这是由多种因素导致的支气管炎症反应。很多时候是因为宝宝免疫功能下降，抵抗病毒的能力变弱，使得病原微生物容易入侵而引发炎症。气道的高反应性致使宝宝在早晨出现咳嗽有痰的情况。治疗上通常需在医生指导下使用抗生素（如阿莫西林）、止咳化痰类药物（如小儿止咳化痰口服液）等。
二、小儿肺炎：
它是常见的呼吸道系统疾病，其发生和病原微生物感染紧密相关，常见致病菌包括金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、呼吸道合胞病毒、流感病毒等。该疾病会引发咳嗽、咳痰、发热等一系列症状，所以会导致宝宝早上起来咳嗽有痰。一般可给予抗菌（如阿莫西林）、抗病毒（如利巴韦林）、化痰类（如布地奈德、氨溴索片）等药物进行治疗。
三、上呼吸道感染：
通常是由于宝宝免疫功能降低，对抗病毒的能力不足，导致原本存在于上呼吸道或从外部侵入的病菌在体内大量繁殖，从而引起上呼吸道感染。因为早上病原微生物相对活跃，所以会出现宝宝早晨咳嗽有痰的现象。治疗一般要给予抗生素（如阿奇霉素）、化痰类（如桃金娘油提取物）等药物。
总之，当宝宝出现早晨起来咳嗽有痰的情况时，要及时就医，明确具体病因，并在医生的指导下进行针对性的治疗。