肚子有时候痛有时不痛可能由多种原因引起，比如胃肠道功能紊乱，这种情况在人群中较为常见，约有10% - 20%的人会经历阶段性的胃肠不适。
胃肠道功能紊乱导致
饮食因素： 如果近期经常吃辛辣、油腻、刺激性食物，像辣椒、油炸食品等，就容易刺激胃肠道，引发肚子有时痛有时不痛的情况。比如连续一周每天都吃较多辣椒，就可能出现这种胃肠不适。精神因素： 长期处于紧张、焦虑、压力大的状态下，也会影响胃肠道的正常功能，导致肚子间歇性疼痛。例如考试前的学生，很多会出现胃肠功能紊乱，肚子有时痛有时不痛。
消化系统疾病引起
慢性胃炎： 患有慢性胃炎的人，胃黏膜处于受损状态，进食后或者空腹时都可能出现肚子疼痛，呈现出时痛时不痛的特点。一般通过胃镜检查可以发现胃黏膜有炎症表现。肠易激综合征： 这是一种常见的功能性肠病，主要症状就是腹痛、腹胀，疼痛部位不定，而且会在排便后有所缓解，疼痛呈现间歇性，有时痛有时不痛。
胆道系统问题导致
胆囊炎： 胆囊发生炎症时，在进食油腻食物后或者夜间等情况，可能会出现右上腹间歇性疼痛，有时疼痛会放射到背部等部位，表现为肚子有时痛有时不痛。通过腹部B超可以辅助诊断胆囊炎。胆结石： 胆结石移动时可能会刺激胆道，引起上腹部或者右上腹间歇性疼痛，疼痛程度不一，有时轻有时重，呈现出有时痛有时不痛的状况。腹部超声是诊断胆结石的常用方法。