HPV感染后多数人没有明显症状，部分人可能出现生殖器部位的异常表现。比如，感染低危型HPV可能会引起生殖器疣，表现为在外生殖器、肛门周围等部位出现单个或多个乳头状、菜花状、鸡冠状的赘生物，大小不一，可能从几毫米到几厘米不等。
生殖器疣相关表现
早期小疣体： 刚开始可能是很小的丘疹，颜色与周围皮肤相近，不容易被发现。发展后的疣体： 随着时间推移，疣体逐渐增大增多，形态多样，有的会融合成较大的团块。
高危型HPV持续感染相关情况
无症状持续感染： 大部分高危型HPV感染属于一过性的，人体免疫系统可自行清除病毒，但有5% - 10%的女性会出现高危型HPV持续感染，此时身体通常没有明显自觉症状，需要通过定期进行宫颈癌筛查来发现异常。可能引发病变后的表现（后期）： 如果高危型HPV持续感染多年，可能会引起宫颈上皮内瘤变等病变，在病变较严重时可能出现阴道不规则出血，比如性生活后出血、绝经后阴道出血等，还可能伴有阴道分泌物增多等情况，但这些表现往往是病变进展到一定程度才会出现，且不是HPV感染特有的症状，需要进一步检查鉴别。
特殊人群的HPV感染表现差异
女性与男性： 女性感染HPV后，除了上述生殖器部位相关表现外，在宫颈部位的感染情况需要通过宫颈细胞学检查、HPV检测等来辅助判断；男性感染HPV后，外生殖器等部位也可能出现类似疣体的表现，不过男性相对女性来说，发生高级别病变的风险相对低一些，但也不能忽视。免疫力低下人群： 比如患有艾滋病等免疫缺陷疾病的人，感染HPV后更容易出现持续感染以及更严重的病变情况，症状可能更难清除，病情进展相对更快。