输精管疼痛可能由多种原因引起。比如附睾炎就可能导致输精管疼痛，据临床统计，附睾炎在青壮年男性中较为常见。
一、炎症因素
附睾炎： 附睾紧邻输精管，当附睾发生炎症时，炎症可能蔓延波及输精管，引起输精管疼痛，同时还可能伴有附睾肿大、疼痛，阴囊部位有坠胀感等表现。前列腺炎： 前列腺的炎症也可能影响到输精管，引发输精管疼痛，患者可能还会出现尿频、尿急、尿痛以及会阴部不适等症状。
二、感染因素
性传播感染： 像淋病奈瑟菌、衣原体、支原体等病原体引起的性传播疾病，如果没有得到及时有效的治疗，可能会累及输精管，导致输精管疼痛。例如淋病患者，如果病情迁延不愈，就有可能出现输精管相关的问题。细菌感染： 身体其他部位的细菌感染，通过血液循环或淋巴循环等途径波及输精管，也会引起输精管疼痛，比如常见的葡萄球菌等细菌感染。
三、损伤因素
器械检查损伤： 在进行一些尿道器械检查，如膀胱镜检查时，如果操作不当，可能会造成输精管的损伤，从而引起疼痛，这种情况一般在检查后较短时间内就可能出现疼痛症状。外伤： 阴囊部位受到外力撞击等外伤，可能会导致输精管受损，进而引起疼痛，同时可能伴有阴囊局部的肿胀、淤血等表现。